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河流、湖泊和水庫中的生物多樣性
中國境內江河、湖泊、水庫眾多，水生生物資源豐富，種類繁多。純淡水魚類近800個種和亞種；輪蟲有348種；淡水撓足類206種；枝角類約162種，接近已知種數40％。淡水藻類尚未完成全面調查，已知藍藻門的色球藻綱有253種，占該綱已知種數80％；綠藻門雙星藻科有347種，占該科已知種數40％，鞘藻屬和毛鞘藻屬有301種、81變種和33個變型。水生維管束植物和大型藻類有437個種與變種。
不同河流、湖庫生物區系和物種多樣性有明顯差別，一般環境優越、發育歷史悠久的大河和大湖生物多樣性較大。
(1)河流
河流生物多樣性有從上游向下游遞增的趨勢。魚類種類很多，上游以喜流性淡水魚類為主，中下游還有溯河性和河口魚類進入。中國河流4大水系中，黑龍江水系是寒溫帶水系的代表，約有魚類100種，包括雷氏七鰓鰻 (Campetra reissneri)、烏蘇里白鮭(Coregonus usuriensis)等冷水種和施氏鱘(Acipenser schrenekii)等北方特有種。黃河水系是暖溫帶水系的代表，約有魚類190個種與亞種。上游種類少，均屬裂腹魚亞科和條鰍亞科種類；中游種數增多，包括鴿子魚(Coreius sepentrionalis)等特有種；下游種類更多，多屬江河平原型和一些回游性魚類。長江水系是北中亞熱帶水系代表，有魚類332個種與亞種，純淡水魚291種，以江河平原魚類為主，鯉科約占一半；鰣(Macrura reevesii)、鰻鱺(Anguilla japonica)等回游性魚類在下游很多。中國特有珍稀魚類白鱘(Psephurus gladius)和胭脂魚(Myxocyprinus asiaticus)主要產于長江。珠江水系是南亞熱帶水系代表，有魚類313個種與亞種，純淡水魚270種，特有種有須鯽(Carassioides cantonensis)、似魷(Luciocyprinus longsoni)等100種。
其余10個水系中，遼河水系和海河水系各有魚100種，區系介于黑龍江和黃河之間。淮河水系有魚120種，區系介于黃河與長江之間。錢塘江水系有魚157種，純淡水魚123種；閩江水系有魚160種，純淡水魚118種，以鯉科和江河習見魚類為主。臺灣島水系和海南島水系各有魚類97種和122種，純淡水81種和105種，區系與大陸相近，瀾滄江、怒江水系和雅魯藏布江水系均屬高原河流，魚種數多，待有種也多．區系復雜，以裂腹亞科、鲃亞科等魚類居多，塔里木河水系魚類僅10余種，包括黑鯽(Carassius carassius)、丁(Tinca tinca)等多個特有種。
(2)湖泊
湖泊中生物資源極為豐富。沿岸帶叢生挺水植物、浮葉植物和沉水植物，在水生植物莖葉上附生各種周叢植物，這里浮游生物和底棲動物種類也很多。在湖心區和深水帶水生植物已難見到，底棲動物種類減少，但浮游生物和魚類仍很豐富。
中國湖泊眾多，根據地理分布分為5個主要湖區：
a.東部平原湖區，包括長江和淮河中下游湖群和黃河與海河下游的湖泊，多屬中營養型和富營養型淺水湖，生物種類豐富(表1)，中國習見淡水生物大多數在這里有分布。如太湖有浮游植物134屬，浮游動物122種，底棲動物68種，水草66種，魚類106種；鄱陽湖有浮游植物154屬，浮游動物112種，水草102種，貝類65種，魚類122種。
表1 5個湖區每個湖中生物種數
b．東北平原和山地湖區，以富營養型淺水湖居多，生物種數不及東部湖區豐富，如鏡泊湖有浮游植物92屬，浮游動物66種，底棲動物22種，水草29種，魚類53種；扎龍湖有浮游植物50屬，浮游動物62種，底棲動物6種，水草26種，魚類21種。
本湖區的特有種除冷水性魚類外，尚有4種貝類(烏蘇里圓田螺(Cipangopolusina ussuriensis)、黑龍江短溝蜷(Semisulcospira amurensis)、東北田螺(Viviparus chui)、珠母珍珠貝(Margaritiana daburica))，4種枝角類(突額仙達溞 (Limnosida frontosa)、興凱秀體溞(Diaphanosoma chankensis)、興凱裸腹溞(Moina chankensis)、小櫛溞(Daphnia cristata))以及12種撓足類。
c．云貴高原湖區，湖泊類型較多樣，生物種類豐富。如滇池有浮游植物205個種和變種，浮游動物171種，底棲動物112種，魚類22種；撫仙湖有浮游植物74屬，浮游動物57種，底棲動物30種，魚類28種。
特有種有2種水草(云南海菜花(Ottelia vunnansis)、大葉海菜花(O. espuiralii))，4種貝類(螺螄(Margarya melanoides)、光肋螺螄(M. mansugi)、陽宗海螺螄(M. gantsunghaiensis)、繪環棱螺(Bellamya limnophila)，1種蝦類(喻氏沼蝦(Macrobrachium yui))，3種枝角類(云南高殼溞(Lurzia yannanensis)、尖吻低額溞(Simocephalus aculirostratus)、翼弧溞(Daphnia lamhdtzi))，11種撓足類和以鯉屬和白魚屬為主的一些魚類。
d．蒙新高原湖區，多為內陸鹽水湖，生物種類貧乏。如博斯騰湖(礦化度1.90g／L)有浮游植物54屬，浮游動物39種。底棲動物5種，魚類21種，水草11種：烏倫古湖(礦化度3.1g／L)有浮游植物23種，浮游動物59種，底棲動物69種，魚類18種。
特有種有5種枝角類(長柱尾突溞(Bythotrephes longimanus)、新疆平直溞 (Pleuroxus sinkiangensis)、粗刺大尾溞(Leydigia leyaigii)、鋸瓜彎尾溞(Camptocercus serratunguis)、蒙古秀體溞(Diaphanosoma mongolianum))，10種撓足類和以雅羅魚亞科及條鰍亞科為主的一些魚類。
e．青藏高原湖區，湖水較深，以貧營養型湖和內陸鹽水湖為主，生物種類貧乏。如青海湖為中國第一大湖(鹽度12.2％)，僅見到浮游植物53屬，浮游動物24種，底棲動物8種，魚類6種；納木錯湖屬寡鹽湖，有浮游植物49屬，浮游動物12種，魚類3種。
本湖區有很多新種和特有種，如輪蟲有三個新種和新亞種及93個特有種，枝角類3個新種(戎裝秀體溞(Diaphanosoma peramatum)、喜馬拉雅低額溞(Simocephalus himalayensis)、阿里尖額溞(Alona aliensis))和4個特有種(耳形船卵溞(Scapholeberis aurita)，帕米爾溞(Daphnia pamirensis)，波紋盤腸溞(Chydorus undulatus)，高原角殼溞(Cornuella annandalei))和橈足類2個特有種(新月北鏢水溞(Arctodiaptamus stewarfianus)，西藏指漂水溞(Acanthodiaptomus tibetanus))。
(3)水庫
水庫一般是在河流上筑壩攔蓄徑流而成的人工湖，其生境介于河湖之間，但生物種數較同類型湖泊為少，例如黑龍江水系8個湖泊中有浮游植物143屬，浮游動物101種，而11個水庫中只有浮游植物93屬，浮游動物95種。由于水位變動很大，水庫中水草十分貧乏，因而周叢生物和底棲動物也不發達。生物多樣性有從上游到下游增加趨勢。中國水庫魚類區系大多以人工放養的鰱、鳙等魚類為主。
(1)漁業的影響
80年代以來，中國水產捕撈業和水產養殖業都有了較大的發展，魚產量逐年增長，但在江河和大湖由于酷漁濫捕，特別是強度捕撈產卵親魚和幼魚及未成熟魚，已導致魚類資源減退。如80年代長江上游的捕魚量僅及60年代的20％，經濟魚類從50多種減到20種左右。湖北省洪湖從1959年到1987年約有70種魚絕跡，漁獲物中97％為小雜魚。有些中國珍稀動物如大鯢(Andrias davidianus)、黿(Pelochelys bibroni)等也因捕撈漸趨稀少。此外不合理的放養和引種魚類也威脅到一些本地特產魚類資源的生存(另見3.12.3節)。
(2)大型水利工程的影響
中國為發展經濟在江河湖泊上興建的水工建筑日益增多，這些建筑物影響回游性魚類和蟹等的產卵和育肥成長，使中國許多重要的水產生物，如中華鱘、白鱘、胭脂魚和銅魚 (Corieus heterodun)的數量和生存受到威脅(另見3.12.3節)。
(3)濫伐森林和圍湖造田的影響
70年代以來不少地方濫伐森林、墾殖山地陡坡，造成嚴重水土流失，河水渾濁度激增，湖庫淤淺，水生生物種類、數量均減少，黃河中游汛期因含砂量過大甚至出現大群魚被窒息而漂浮水面順流而下的“流魚”現象。幾次大規模的圍湖造田使沿岸植物毀滅，周叢生物和底棲動物大為減少，魚類產卵場被破壞。有些地方將湖填平造田，使水生生物完全失去棲息場所。
(4)水污染和富營養化的影響
北方河流水量小，自凈能力低，污染造成的影響尤為嚴重。嫩江自1959年起連續多年因制糖、造紙污水大量排入，導致冬季冰下缺氧和周期性大量死魚現象。黃河中游近年已發現汞、酚、鉛等在魚體內富集。
城市污水的排入大大促進了水域的富營養化，使浮游生物種類單純化，水草、底棲動物和魚類激減。武漢東湖近20～30年，由于生活污水流入和發展養魚業的影響，浮游動物從203種減到171種，底棲動物從113種減到26種，在漁獲物中除放養魚類外，原有60余種魚已難見到。
(5)水域鹽堿化的影響
水域鹽堿化現象在北方較為廣泛，許多不耐鹽的淡水生物逐漸消失，少數喜鹽或耐鹽種數量增長。碳酸鈉型湖總堿度和pH值的升高常先于鹽度而威脅生物的生存，在同樣鹽度下物種的豐富度遠低于其他類型鹽水湖。水草和魚類對鹽堿度的耐性低于藻類和無脊椎動物，在鹽堿化過程中種數將首先減少。內蒙古黃旗海50年代是一個淡水湖，以后由于入湖河水被攔截，鹽堿化加劇，水草減少，魚產量下降。1972年鹽度7.8g/L，總堿度0.53g/L，pH 8.9，魚類開始大量死亡，80年代已完全無魚。
中國政府從70年代末已注意到內陸水產資源和水域環境的保護。1980年組織了以黑龍江、黃河、長江和珠江四大水系為主的內陸水域漁業資源調研；80年代以來對江河湖庫的環境質量進行廣泛調查，劃分了水源保護區，提出排放標準。1979年以后先后頒布了“水產資源保護條例”和“漁業法”，宣傳和嚴格執行“環境保護法”和“水污染防治法”。盡量減少水利工程建設對生物資源的不良影響，在規劃和興建大型水利工程時同步研究工程的生態影響，并制訂防止不利影響的對策。禁止盲目毀林墾荒，停止湖泊圍墾和放水涸田。注意保護珍稀和瀕危動物。1981年在長江全江段設站保護中華鱘(Acipensr sinensis)，安徽和浙江兩省分別建立了揚子鱷(Alligator sinensis)自然保護區和養殖場。水產部門研究和實行按生態學規律開發和管理內陸漁業，提倡根據水域魚產力和生物群落特點確定湖庫放養標準和合理引種；妥善處理增產和水域富營養化的關系；擬定科學的捕撈規格和定額。這些做法同時也起到保護水域生物多樣性的作用。
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