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中美倡議啟動“地球生物基因組計劃”

http://www.m.qdwlx.cn 2017-03-01 來源:中國科技網(wǎng) 作者: 發(fā)表評論(0)

  在美國斯密森尼生物多樣性基因組學(xué)項目組與中國華大基因公司近日聯(lián)合主辦的生物基因組學(xué)會議(BioGenomics2017)閉幕論壇上,加州大學(xué)戴維斯分校基因組學(xué)家哈瑞斯·萊文等人和華大基因生物學(xué)家張國捷等組成的科研團隊聯(lián)合倡議,全球科學(xué)家合作開啟另一項與人類基因組計劃(HGP)類似的項目——地球生物基因組計劃(EBP),對地球上所有真核生物進行測序。

  據(jù)《科學(xué)》雜志官網(wǎng)報道,EBP計劃大約兩年前第一次提出,將著重對包括所有植物、動物和單細胞生物在內(nèi)的真核生物群體進行測序。倡議團隊估計,得益于測序技術(shù)的進步和成本下降,可能只需10年時間以及與HGP相當(dāng)?shù)馁M用(約27億美元),就能完成對全部真核生物的測序。

  現(xiàn)有EBP框架大約分三步完成:第一步,為9000個真核生物科中的每科選出一個代表進行DNA測序,獲得的參考基因組要與人類基因組相當(dāng)或更好;第二步,對15萬到20萬個真核生物屬中每個屬選取一個物種測序,詳細程度不需達到第一步的標(biāo)準(zhǔn);第三步,對150萬個真核生物物種進行粗略性測序。

  項目倡議人員表示,EBP已經(jīng)取得良好開端,好幾個測序項目已經(jīng)啟動,包括為1萬種脊椎動物進行基因組測序的基因組10K項目、破譯5000種節(jié)肢動物基因組的i5K項目、為1萬多種禽類物種測序基因組的B10K項目等。“我們就是要把EBP打造成‘戰(zhàn)斗機中的戰(zhàn)斗機’。”萊文說。

  在會議上,中國華大基因和英國韋爾科姆基金會桑格研究所等基因組學(xué)領(lǐng)頭企業(yè),表明了積極參與的立場,但EBP項目目前仍面臨重大挑戰(zhàn):一是因生物多樣性問題,只有更多發(fā)展中國家參與并開展更加國際化的合作,該項目才能最終成型;二是制定高質(zhì)量測序和保存有機體樣本的標(biāo)準(zhǔn),其中因現(xiàn)有博物館動植物樣品的保存方式不符合要求,或需要大量的野外采集樣品,這可能耗費很大成本。

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